孙悟空最为畏惧的妖怪是谁？许多人认为是九灵元圣。九灵元圣是太乙救苦天尊的坐骑，本体为一只九头狮子，修为已达超凡入圣的境地，因此号称“妖中之圣”。他能够“喊一声，上通三圣，下彻九泉”，因此其威名显赫。作为妖中之圣，九灵元圣的实力自然非同小可，连孙悟空这位曾闹过天宫的大圣都自愧不如。

在原著第九十回，九灵元圣为了替自己的孙子——黄狮精报仇，抓住了唐僧和猪八戒等人。孙悟空得知后，带着沙僧气势汹汹地前去营救，杀到九曲盘桓洞。出乎意料的是，九灵元圣并未展示任何畏惧，“身无披挂，手不拈兵，大踏步走到前边”，随即大开洞门，径直朝孙悟空走去，没有任何言语回应。面对孙悟空，九灵元圣连兵器都懒得带上。孙悟空见此情形，立即意识到九灵元圣的非凡实力，立刻提起金箍棒，准备与之一较高下。

九灵元圣躲过了孙悟空的一击，双方展开了激烈的对战。经过两三个回合，九灵元圣突然大喝一声，施展出了九口擒拿术，他的九个口瞬间露出真身，猛然摇头张嘴，迅速将孙悟空和沙僧生擒至洞府。虽然孙悟空随后使用法术逃脱，但他深知九灵元圣的厉害，再也不敢轻易挑战，转而向太乙救苦天尊求助。

然而，尽管九灵元圣法力强大，孙悟空对他却并没有过于畏惧。太乙救苦天尊曾提到，“我那元圣儿也是久修得道的真灵，等闲也不伤生”，九灵元圣不喜欢轻易伤害生灵，既然如此，孙悟空又为何要害怕他呢？

实际上，孙悟空最怕的妖怪应该是青牛精。青牛精是取经路上最为凶猛的妖怪之一，连玉帝和如来都对他敬而远之。青牛精是太上老君的坐骑，因觊觎唐僧的肉身而下界为妖，最终抓住唐僧，将他囚禁在金兜洞，由此与孙悟空发生了激烈冲突。

孙悟空冲入金兜洞，要求青牛精释放唐僧，然而青牛精不仅不放人，反而屡屡挑衅，讽刺孙悟空曾是弼马温，故意激怒他。孙悟空怒不可遏，举起金箍棒与青牛精激战。然而，青牛精不仅气焰嚣张，而且实力强大，孙悟空与他斗了整整五十回合，竟然占不到一丝便宜。更糟糕的是，青牛精拥有金刚琢，这件法宝能够套住任何兵器，孙悟空的金箍棒被轻松套走，孙悟空因此狼狈逃窜。

面对这样的对手，孙悟空意识到自己无法取胜，只得向天庭的玉帝求助，试图打探青牛精的背景。可玉帝明知青牛精是太上老君的坐骑，却故意不告诉孙悟空，反而派遣天兵天将前去支援。即便是天兵天将，也无法抵挡青牛精的强大，青牛精轻松将他们的兵器法宝套走，令天兵天将们纷纷败退。

孙悟空见天兵天将也无力回天，于是转而求助如来，试图了解青牛精的底细。然而，如来同样拒绝了他的请求，甚至表示，如果透露青牛精的身份，万一孙悟空将其卖了，青牛精闯入灵山，那就麻烦了。连玉帝和如来都避而不见，足见青牛精的恐怖。孙悟空被逼得走投无路，甚至想出了一个险招，差点就让唐僧丧命于金兜洞。

在原著第51回，孙悟空见天兵天将无法对付青牛精，竟决定水淹金兜洞。他指使水伯将黄河水装进水盂，朝金兜洞倾泻而去。唐僧此时正被青牛精囚禁在洞中，如果水淹洞内，唐僧必定难逃一劫。托塔天王李靖见状提醒孙悟空，这个计谋虽巧妙，但恐怕连师父也会被淹死。孙悟空却毫不在意，甚至表示，若淹死师父，他自有办法让师父复活。可见，孙悟空对青牛精的畏惧到了何种程度。幸好青牛精及时堵住了水源，唐僧才得以幸免于难。

最终，在如来的暗示下，孙悟空终于向太上老君求助。太上老君亲自出马，将青牛精带回兜率宫，孙悟空这才过关斩将，成功解救了唐僧。